战国中期，诸侯相互征伐，弱肉强食。秦国频繁发生君臣陵替的宫廷动乱。三晋强国之一的魏国乘隙发兵侵占西河重镇。秦孝公决意励精图，洗雪国耻，重振先祖秦穆公未尽之恢弘霸业……魏国相国公叔痤临终前将家臣卫鞅举荐给魏王，希望魏惠王委以重任。为魏惠王拒绝。公叔痤断言卫鞅日后定能做出一番惊世骇俗的非凡业绩。疾贤妒能的公子昂获悉卫鞅将要西赴秦国求仕，极力撺掇魏惠王杀了卫鞅……
　　
　　卫鞅两番觐见秦孝公，针对秦国当前的实际情况，提出“劝农耕战”的发展战略方针——实施‘废井田，开阡陌’；大力奖励耕作，鼓励百姓积极投身于农业生产；褒奖军功，取消贵族特权；选贤拔能，裁撤庸吏……秦孝公决意实行新政。上大夫甘龙及杜挚首先反对。卫鞅当堂驳斥甘龙之流的保守观点，一针见血地指出：秦国只有走变法图强之路才能真正实现富国强兵。秦孝公大受鼓舞，委任卫鞅为左庶长，全权负责变法政务。朝廷百官打算联名上奏劝谏秦王收回成命……两村村民们为争渠水灌溉而发生了殴斗；纨绔子弟们恶毒攻击针对贵族特权限制的新法条令；万源粮店擅自哄抬粮价，坑害平民百姓，牟取暴利，引起平民百姓们的极大愤慨……卫鞅潜行到西粮市，了解到军营内部贪污腐化卖官鬻爵等肮脏黑幕交易情况……心怀鬼胎的中军元帅子都派心腹纵火焚烧粮仓……在无可辩驳的事实目前，赵万三等一干人犯均供认不讳。卫鞅痛斥子都赵万三之流坑害国家肥己私囊的卑劣行径；抨击了腐朽不堪的官僚腐败体制的罪恶。并通过河西战役的惨痛教训激发起官兵卫国保家的爱国激情。众将士无不为左庶长大刀阔斧的改革而欢欣鼓舞。关键证人尹良仕给卫鞅提供了有关子都一伙倒卖军粮的罪证。公孙贾深恐与子都暗中所进行的肮脏交易被卫鞅查出，决定丢车保帅……
　　
　　一伙声称自己是苦于新法逼迫的终南山盗匪乘着月黑雨骤之夜，在京城大肆疯狂抢劫大户财物，并残杀众多人口，手段残忍毒辣。朝野上下震动，顽固派乘机散布谣言攻讦新法……各地财主纷纷假借新法名义，变本加厉盘剥、压榨租种佃户们，逼使许多穷苦百姓家破人亡……神秘组织操纵粮行及盐商囤积居奇，哄抬粮盐售价，逼使平民百姓铤而走险……尉迟诩秉承卫鞅使命上终南山向义军传达朝廷招安的意向……卫鞅派专使携亲笔信去魏国迎接瑶姬。公子昂从中作祟……展都尉一举捣毁了神秘组织的巢穴，终于挖出令人震惊的大蛇。冯、展二人规劝卫鞅要慎重对待此事……太子受公孙贾和公子虔误导，当着文武大臣面对新法展开尖锐批判……渭水河畔，卫鞅处决了七百余名罪大恶极的死囚……经过整顿，秦国百姓安居乐业，官吏皆悉心用命，克尽职守。
　　
　　穷凶极恶的二头领在军师‘活神仙’的教唆下，杀害了尉迟诩，准备兴师下山杀奔京城……庞涓向魏惠王进献“蚕食诸侯，问鼎天下”的国策，率兵攻打赵国。公子昂撺掇庞涓攻打秦国。庞涓不以为然。卫鞅派人再次前往魏国接取瑶姬。谁知早已人去楼空……魏国元气大伤。头脑清醒的韩大臣申不害建议韩国走卫鞅富国强兵的变法道路。韩王让申不害负责主持变法事宜。洞察风云变幻的卫鞅决定乘魏国元气大伤之际出兵伐魏，光复失地。自作聪明的公子昂向魏惠王毛遂自荐，率军出征。卫鞅针对魏军倍于己方，决定采取智取……卫鞅决定乘胜进军魏都安邑。魏惠王手足无措。大臣龙贾建议利用故土乡情游说卫鞅撤围。彷徨无计的魏惠王只好谴使者向卫鞅求和。魏惠王无奈，只好答应从河西地带撤军，并懊悔当初没有听从公叔痤的忠告。
　　
　　韩国宰相申不害在去秦国拜会卫鞅途中被阴谋杀害。卫鞅也险些遭人暗算……周天子册封秦孝公为诸侯方伯。秦国国势如日中天，秦孝公大喜，遂册封卫鞅为商君。诸侯会盟之时，心存疑惑的卫鞅向韩王询问申不害的死因。韩王却闪烁其词……
　　
　　卫鞅决定采取在全国实行郡县制。并从秦国的长远发展规划考虑，倡议迁都咸阳。此举再次遭到了顽固保守派强烈的反对。受到巫师唆使的京城百姓齐聚王宫门前向朝廷请愿，要求秦王中止迁都咸阳……
　　受卫鞅挫败了甘龙为首等人的诡计……卫鞅率雍城百姓往咸阳迁都……居心叵测的博士赵良假借道贺之际，当众肆意贬斥商鞅所推行的新法举措……一向对商鞅钦佩有加的墨家弟子禽滑厘意识到商鞅身处险境，规劝商鞅警惕潜伏的政治危机……卧病在榻的秦孝公召商鞅进宫畅谈，阴险的公子虔教唆世子赶采取“非常手段”扭转乾坤……弥留之际，秦孝公告诫儿子——无论如何都不能废除商鞅所推行的一切新法。秦孝公晏驾当日，景监以死向商鞅发出了预警信号……公子虔授意顽固派无中生有捏造“莫须有”的罪名联名弹劾商鞅。不料秦惠文王只是罢免了卫鞅的相国职务，放其归隐商於封地。心领神会的公子虔授意顽固保守派收罗商鞅“谋逆罪状”，对卫鞅早存杀心的秦惠文王顺水推舟，下旨命公孙贾率军马捉拿卫鞅……商鞅回到魏国，谁知魏国君臣都不念当初商鞅保全魏国的大恩，决定将其缚送与秦国，借刀杀人……为避免军民遭受生灵涂炭，商鞅遂自行解除武装，并且拒绝了军营将士们劝其率军马进京与秦惠文王谈判的建议，自缚双手，听凭公孙贾将自己押回咸阳受审。秦惠文王以“谋逆反叛”罪名将商鞅处以“五牛分尸”的残酷极刑…… 自以为得计的公子虔等人乘机建议秦惠文王废除商鞅所颁行的一切新法条令，复辟旧制。不料秦惠文王驳斥了甘龙及诸大臣的所谓新法乱国的谬论，盛赞卫鞅变法的丰功伟绩，并明白告诉群臣：自己不但要将商鞅所推行之新法一字不改地完完整整地保留并沿用下来……顽固保守派大受打击。一百多年之后，秦始皇登临长城，盛赞商鞅变法的丰功伟绩，并由衷赞叹：秦国终于得以实现了图霸中原一统天下的夙愿，并缔造了第一个空前强大的大秦帝国——而这一切全归功于商鞅变法的丰功伟绩，商鞅实不愧为大秦第一功臣。