商朝末年，纣王无道，周武王起义兵伐纣。天界大神、截教祖师“通天教主”力挺纣王，阻挠武王进军，终于使得天怒人怨，爆发了天、地、人三界大战。东方圣教始祖元始天尊、老子和西方二圣准提祖师、接引大师联手讨伐通天教主，大破“通天万仙阵”，将通天教主驱逐到东海蓬莱岛。商纣兵败，商灭周兴，但通天教主不甘失败，在蓬莱岛炼制万魂幡，将万仙阵中被杀的数万神仙的怨魂积聚在万魂幡中，毁天灭神、再造三界。元始、老子、接引、准提在万魂幡炼制完成前赶到蓬莱，再次击败通天教主，将通天封印在准提的神器“六道宝轮”中。但万魂幡被毁，数万仙神之灵无处寄存，恰巧临近蓬莱的东胜神州一块大石中孕育着集天地灵气而生的石猴，众仙灵被灵气吸引接近大石，全被石头中孕育的石猴吸收。
　　许多年后，石猴孙梧桐诞生，实力之强大远超天界神佛的预期。梧桐大闹天宫，轻易打败了二郎神君，天军全军覆没，连玉帝也被打下凡间。准提祖师虽将孙梧桐压在三行山下，但也对梧桐深怀忌惮。此时被封印在六道宝轮中的通天教主趁准提祖师重伤不备，重获自由，反将准提祖师封印，自己化身为准提，控制了西方圣教，欺世盗名，将满天神佛玩弄于股掌之中。
　　五百年后，上西天取经的三藏法师经过三行山，救了孙梧桐性命，收梧桐为徒。而发现了六道宝轮情况有异观音、文殊、普贤三菩萨商议推举新教祖，密谋之事被观音莲花池中的鲤鱼精听去，告知了九天十地所有妖魔，众妖魔纷纷下界作乱，人间从此不得安宁。
　　梧桐一行一路斩妖除魔，终于接近西方净土。通天变化成的准提祖师因六道宝轮破损，六道因果失常，失去了对九天十地的控制，为保住自己天上天下、唯我独尊的地位，不择手段搜集天下的先天灵宝，最后因物欲贪婪难以自控而彻底堕落魔道。观音等上界元老欲让梧桐晋身为“斗战圣佛”以取代准提祖师。准提祖师则指使太上老君将二郎神君的尸体炼化成为二郎犬神，令其在灵山脚下狙杀孙梧桐，不料阴差阳错误将三藏杀死，梧桐的师弟八浄、霎生也陆续被准提手下仙佛诛杀，而梧桐的故居花果山也遭劫难。梧桐在观音指点下，找到了创世之初的四大屠神具，到西方圣境与准提教祖一战……