1944年秋夜，一架盟军“飞虎队”的轰炸机飞往湖南岳阳去轰炸日寇，却不幸在四川峨眉山撞山坠毁，沉落到小凉山彝族地区。机组人员中除年轻的领航员加里一人生还外，其余全部遇难。幸亏彝人头领尼胡木笛的大学生女儿尼胡妞妞（汉族名字陈雨虹）及时赶到，奇迹般救了加里的性命。
　　
　　对峨眉山自然遗产保护和研究的共同志趣把二人紧紧地联系在了一起。加里写了一封向美国领事馆的求救信请马帮头子尼胡罗乌带出汉地去后，便和陈雨虹一道策马往风光如画的宝山峨眉考察而去。
　　
　　峨眉山上科考一周，同是地球物理专业出道的环保志愿者加里和陈雨虹成为了形影不离的恋人。却不料下山之后，加里被羁留峨眉县伪政府，雨虹在加里的皮包里发现了他与一位金发少女的亲密合影后不辞而别。
　　
　　雨虹赌气地回到山寨惊骇地发现家园已不复存在，原始森林中烈火熊熊，山寨到处尸横遍野、血流成河。头人父母也与世长辞。幸存者含泪告诉雨虹：血洗山寨的国民党军队正是加里写信搬来，沉重的打击一下把雨虹推向了崩溃的边沿。
　　
　　坚强的陈雨虹置于死地而后生，在识破改头换面诈骗她《黄金勘探资料》的国民党女特务真面目后毅然跳进悬崖下的大渡河脱身。并有惊无险被峨眉山高僧慧觉老尼搭救隐藏在寺庙中等待转机。
　　
　　却不料消息再次走漏，国民党又派出留学日本的妙龄美女特高课沈韵中校乔装打扮成红颜命薄的民女也来萝峰俺削发为尼，与陈雨虹零距离接触再行骗取其《金矿勘探图》。在进行了一系列惊心动魄的较量和反侦破的斗争之后，陈雨虹偕正义的峨眉佛门武士们把女特务击毙于大渡河畔。连同埋伏增援的一个连的国民党黄狗兵也悉数被陈雨虹唤来的万人彝族大军全部俘并获押上了小凉山。
　　
　　正是这一轮谍战，才让慧觉大师恍然大悟，揭开了谜底。原来陈雨虹本不是彝族人, 且还有一个汉人血统的亲哥哥活在人世的真正的身世。二十年前，雨虹的生身父亲陈文凯教授因为反对国民党政府在峨眉山上开采金矿的破坏环境的败家子行径，将峨眉山金矿的勘探图文资料转移藏匿而被国民党当局追杀，陈文凯夫妇双双遇难。小雨虹被慧觉的在家居士弟子尼胡木笛头人救上小凉山，哥哥峨峨则被寺庙收养，慧觉教给他古琴技艺后终远走天涯。
　　
　　至此慧觉师傅就精心传授陈雨虹的七弦琴技艺。并告诉她只要凭得同样会弹一首单传的《般若波罗蜜颂歌》，就有希望找到她的亲哥哥峨峨。
　　
　　慧觉大师圆寂后，陈雨虹（法名悟明）继任了纯阳殿的住持。新中国的成立送来了上山的建设大军，悟明喜出望外地见到了自己早年的暗恋者曲别罗乌——当年为加里带信出去的那位马帮头子——汉族名字高云非。在新中国建设的召唤下，悟明离开寺庙，投入了社会主义建设的热潮，并被任命为峨眉山研究所副所长。为了纪念生父陈文凯、养父尼胡木笛和慧觉大师三位人杰，还俗后的悟明更名为陈尼慧。
　　
　　高云非遂又开始了他对陈尼慧的第二次追求，但陈尼慧心中依旧装着加里。正在这时文革开始，造反派头头高云非便发动他的小兄弟们以谣言开道，想以此逼陈尼慧就范。却不料半路杀出个造反队，要抓里通美国飞行员的陈尼慧去揪斗，搅翻了高云非的如意算盘。
　　
　　待到这场恶梦醒来，已是满天朝霞的改革开放之年……
　　
　　八十年代，中国迈开大步走四化强国之路。美国环球旅游开发集团总裁加里重返故地，与担任峨眉山科学院院长的陈尼慧重逢。
　　
　　痛说别情之际，加里拿出当年被人改写掉包，从而引来山寨横祸的那封“求救信”来证明自己的清白和无辜，却让陈尼慧识破了这正是出自高云非的笔迹的阴谋。
　　
　　文革中流落在外的盲流高云非良心发现，重返故地为峨眉山，也为陈尼慧戴罪立功，洗刷自己的灵魂。但为了资助陈尼慧出版她几十年为之奋斗的峨眉山的著作，竟又走上了为文物盗窃团伙充当内应来获取资金的可悲途径，受到公安部和国家安全部的通缉。
　　
　　故事大结局，当众叛亲离、走投无路的高云非含泪弹响了七弦琴曲《般若波罗蜜颂歌》，羞愧地跳下舍身崖时，陈尼慧才知道他就是自己寻找了一生的亲哥哥。于是，一曲断肠悲歌奏响在峨眉山那云遮雾障的雄秀山水间……